Tout commence avec la sortie du film « Killing Fields » (« La déchirure »). Dans ce film, Roland Joffe raconte l'histoire du journaliste américain Sidney Scharnberg et de son adjoint cambodgien Dith Pranh couvrant les dernières semaines du régime de Lon Nol au Cambodge, en 1975. Dith Pranh, pris au piège de Phnom Penh le 17 avril 1975, parvient à survivre au régime génocidaire instauré par les Khmers rouges. Dans « Killing Fields », c'est un médecin, le Dr Aing Ngor, lui-même victime du régime KR, qui interprète le rôle de Dith Pranh.

En 1988, à l'initiative du Dr Ngor qui a offert une partie des gains tirés de son rôle dans le film, l'association « Les Enfants d'Angkor » est créée en France après avoir germé dans l'esprit d'un Belge ayant travaillé dans les camps de réfugiés cambodgiens en Thaïlande et ayant connu Aing Ngor. Cette association vise à soutenir des enfants cambodgiens - orphelins ou issus de milieux particulièrement pauvres - par un système de parrainage individuel.

La même année, grâce à la participation du Dr Ngor à un débat ayant suivi la projection de « Killing Fields » sur une chaîne de télévision belge, l'idée naît de créer une association-soeur en Belgique, toujours avec l'aide du médecin cambodgien. Le 12 octobre 1989, les statuts des « Enfants d'Angkor-Belgique » paraissent au Moniteur belge et, quelques jours plus tard, le Dr Ngor donne une conférence de presse à Bruxelles ; très vite, les premières demandes d'informations arrivent, et dans la foulée, les premiers parrainages.
Le « décollage » de l'Association Angkor-Belgique se produit en décembre 1991 lors de la diffusion d'une émission intitulée « Vent du Sud », consacrée à l'enfance cambodgienne. Cette émission met en lumière le travail de l'association belge, dont les représentants sont présents sur le plateau. Le Dr Ngor y participe également, tout comme Nop Sideth, réfugiée cambodgienne à Bruxelles, ainsi que les fondateurs français et belges de l'association.

Petit à petit, l'association belge a grandi et s'est structurée jusqu'à franchir une étape capitale : elle devient indépendante de sa consoeur française par décision adoptée le 20 juillet 1996 et prend le nom d'Association Angkor-Belgique, dont les statuts sont publiés au Moniteur. Son objectif prioritaire reste le même : offrir à des enfants démunis l'accès à l'éducation, l'un des droits fondamentaux de la Convention Internationale des Droits de l'Enfant.